I granulociti basofili rappresentano <1% dei globuli bianchi circolanti. I basofili sono simili ai mastociti in quanto esprimono il recettore IgE ad alta affinità e secernono citochine e mediatori infiammatori in seguito a stimolazione con l’allergene. A differenza dei mastociti che sono cellule fisse, i basofili sono cellule circolanti nel sangue. I basofili presentano in superficie recettori ad alta affinità per le IgE (FcɛRI) che legano le IgE alla loro superficie. Quando le IgE adese alla superfice del basofilo si legano con l’allergene si ha la loro degranulazione con rilascio all’esterno della cellula di istamina e altri mediatori implicati nell’anafilassi. Contemporaneamente alla degranulazione del basofilo aumenta sulla membrana cellulare l’espressione di due marcatori di superficie, CD63 e CD 203c. Questo fenomeno ha reso possibile utilizzare la citometria di flusso per controllare la degranulazione dei basofili quando vengono posti a contatto con l’allergene.